金粟庵位于南京市秦淮区金粟庵路22号，与现瓦官寺隔街相望，为后人在瓦官寺遗址上修建的大小寺庵之一。取顾恺之绘维摩诘示疾壁画的典故，因维摩诘居士乃金粟如来应世，故称金粟庵。

清咸丰（1851－1861年）年间毁于兵燹，同治十二年(1873年)重修。解放前夕，尚保留有大三进、小三进，共有山门、大殿、祖师殿、客堂、寮房、斋堂等房屋数十间，建筑面积1000余平米。

二十世纪五十年代，庵内房屋被几家单位占用。1993年，经南京市人民政府批准对外开放，恢复正常宗教活动，房屋逐渐归还。1994年，日本天台宗青年联盟代表团前来该寺隆重举行“天台大师圆寂1400周年纪念法会”，并赠送天台智者大师铜像供奉于庵内。庵内现有大殿3间、方丈室1间、钟楼1小间。庵门额上“古金粟庵”四个金字，系赵朴初亲笔所题。