原全国政协副主席丁光训主教在此座堂，中国基督教三自爱国会主席季剑虹长老在本堂工作数年。从1985年复堂以来，历任主要负责人为陈泽民（1985年—1995年）、徐如雷（1996年—2005年）。现任主任牧师为阚仁平，教堂有专职牧师6位，传道员2位，行政人员3位，信徒3000余人。

圣保罗堂始终坚持“自治、自养、自传”的“三自”原则，以丁光训主教神学思想为导向，将神学思想建设成果“下基层”“上讲台”“入人心”。多年来，圣保罗教堂坚持从严治教，提倡崇俭戒奢的良好作风，引导广大信徒与社会主义社会相适应，践行社会主义核心价值观，稳步推动了南京基督教中国化进程。作为南京教会外事接待的窗口，在接待来自世界各地的基督教代表团和知名媒体中发挥了积极作用。

圣保罗堂被中央统战部、国家宗教事务局表彰为“首届全国创建和谐寺观教堂先进集体”，被江苏省民宗委评为“五星级宗教活动场所”，被南京市城市治理委员会评为“南京市城市治理标准化示范单位”。